دليل عمليات البرنامج (MOP) هو الوثيقة المرجعية لتنفيذ البرنامج. وهو يصف “كيفية” تنفيذ الاتفاقات والقرارات المتخذة خلال مرحلتي وضع البرنامج والتفاوض بشأنه. وهو يغطي آليات وإجراءات التنسيق والتنفيذ، والجهات الفاعلة وطريقة عملها، وإجراءات صنع القرار. كما يصف برنامج التشغيل الآلي أيضاً آليات رصد وتقييم البرنامج ويعرض المتطلبات/العمليات الائتمانية والبيئية والاجتماعية.